ภายหลังจากการยื่นขอจัดตั้งหอการค้าจังหวัดภูเก็ตในครั้งแรก ปรากฏว่ามีปัญหาและข้อขัดข้องหลายประการ อาทิ กรรมการผู้ขอจัดตั้งบางท่านมีคุณสมบัติไม่เป็นไปตามข้อกำหนด ตราสัญลักษณ์ของหอการค้าจังหวัดภูเก็ตยังคงใช้ตราของสมาคมพ่อค้าจังหวัดภูเก็ตเดิม โดยเปลี่ยนเพียงชื่อเป็น PKCC (The Phuket Chamber of Commerce) รวมถึงความไม่ชัดเจนเกี่ยวกับที่ตั้งสำนักงานหอการค้า เป็นต้น ส่งผลให้การขอจดทะเบียนจัดตั้งหอการค้าจังหวัดภูเก็ตในครั้งนั้นต้องระงับไว้ชั่วคราว

จากความไม่พร้อมในหลายประการดังกล่าว กรมการค้าภายใน กระทรวงพาณิชย์ จึงได้เสนอแนวทางแก้ไข โดยประสานไปยังคณะผู้ริเริ่มจัดตั้งหอการค้าจังหวัดภูเก็ตให้ดำเนินการปรับปรุงข้อบังคับให้เหมาะสมและรัดกุมยิ่งขึ้นก่อนการออกใบอนุญาต โดยมีข้อเสนอให้แก้ไขจำนวน 2 ข้อ ดังนี้

ข้อ 25

ให้ยกเลิกข้อความเดิม และใช้ข้อความใหม่ ดังนี้

“การรับรองรายงานของคณะกรรมการหอการค้า เมื่อมีการเลือกตั้งคณะกรรมการชุดใหม่แต่ละครั้ง ไม่ว่าจะเป็นกรณีครบวาระ หรือกรณีคณะกรรมการชุดเดิมลาออกทั้งคณะ ให้คณะกรรมการหอการค้าชุดใหม่ยื่นจดทะเบียนเป็นกรรมการหอการค้าต่อนายทะเบียนหอการค้าจังหวัดภูเก็ตภายในระยะเวลา 30 วันนับแต่วันเลือกตั้ง และให้เข้ารับมอบงานจากคณะกรรมการชุดเดิมของหอการค้าภายใน 30 วันนับแต่วันที่นายทะเบียนรับจดทะเบียน หากยังไม่มีการยื่นขอจดทะเบียนคณะกรรมการชุดใหม่ตามกำหนด ให้ถือว่าคณะกรรมการชุดเดิมยังคงปฏิบัติหน้าที่ต่อไป”

ข้อ 30

ให้แก้ไขข้อความจากเดิม

“ภายในเดือนเมษายนของทุกปี และไม่เกิน 120 วันนับแต่วันที่สิ้นปีการบัญชีของหอการค้า”

เป็น

“ภายในเดือนเมษายนของทุกปี หรือ ไม่เกิน 120 วันนับแต่วันที่สิ้นปีการบัญชีของหอการค้า”

สำหรับข้อบังคับอื่น ๆ ไม่ปรากฏข้อบกพร่องแต่อย่างใด อย่างไรก็ตาม ในช่วงเวลาดังกล่าวสมาคมพ่อค้าจังหวัดภูเก็ตยังมิได้ดำเนินการแก้ไขข้อบังคับตามข้อเสนอแนะดังกล่าว ทำให้เรื่องการจัดตั้งหอการค้าจังหวัดภูเก็ตต้องชะลอไว้จนถึงช่วงปลายปี พ.ศ. 2525

ต่อมา ในสมัยที่ นายจิรทีปต์ เอกเพิ่มทรัพย์ (ชื่อเดิม นายถาวร ตันติศิริไพบูลย์) ดำรงตำแหน่งนายกสมาคมพ่อค้าจังหวัดภูเก็ต ทางจังหวัดได้ประสานขอความร่วมมือให้มีการดำเนินการจัดตั้งหอการค้าจังหวัดภูเก็ตขึ้นอีกครั้ง และการจัดตั้งในครั้งนี้ได้ดำเนินการสำเร็จโดยสมบูรณ์ เมื่อวันที่ 17 พฤศจิกายน พ.ศ. 2526 โดยได้มีการแก้ไขข้อบังคับทั้ง 2 ข้อให้เป็นไปตามข้อกำหนดของกรมการค้าภายในเรียบร้อยแล้ว

ต่อมา ได้มีการจัดประชุมสามัญใหญ่ประจำปี ครั้งที่ 1/2527 เมื่อวันที่ 19 มีนาคม พ.ศ. 2527 ซึ่งที่ประชุมมีมติแต่งตั้งคณะกรรมการบริหารชุดที่ 1 จำนวน 21 ท่าน และมี นายจิรทีปต์ เอกเพิ่มทรัพย์ ดำรงตำแหน่ง ประธานหอการค้าจังหวัดภูเก็ต เป็นท่านแรก

นอกจากนี้ ยังได้มีข้อเสนอให้ผู้ว่าราชการจังหวัดหรือรองผู้ว่าราชการจังหวัดเข้ามาทำหน้าที่เป็นที่ปรึกษาเป็นการส่วนตัว เพื่อสนับสนุนการดำเนินงานของหอการค้าจังหวัดภูเก็ตให้สามารถขับเคลื่อนบทบาทในการพัฒนาเศรษฐกิจของจังหวัดได้อย่างมีประสิทธิภาพยิ่งขึ้น อีกทั้งยังเป็นการส่งเสริมให้การดำเนินงานของคณะกรรมการร่วมภาครัฐและเอกชนเพื่อแก้ไขปัญหาทางเศรษฐกิจจังหวัด (กรอ. จังหวัด) เป็นไปตามแนวนโยบายของ กระทรวงมหาดไทย อย่างเป็นรูปธรรม

จากแนวทางการปรับปรุงและพัฒนาในทั้งสองประการดังกล่าว ได้นำไปสู่การเรียกประชุมเพื่อแต่งตั้งคณะกรรมการหอการค้าจังหวัดภูเก็ตขึ้นใหม่ เมื่อวันที่ 30 พฤศจิกายน พ.ศ. 2531 โดยผู้ว่าราชการจังหวัดภูเก็ตได้เชิญนักธุรกิจ พ่อค้า และบุคคลผู้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาเศรษฐกิจของจังหวัดภูเก็ตเข้าร่วมจำนวน 49 ท่าน ซึ่งนับเป็นจุดเปลี่ยนสำคัญของการฟื้นฟูบทบาทและการขับเคลื่อนภารกิจของ หอการค้าจังหวัดภูเก็ต ให้ก้าวเข้าสู่ “ยุคใหม่” อย่างเป็นรูปธรรม และเป็นรากฐานสำคัญของการพัฒนาองค์กรให้มีความเข้มแข็ง พร้อมทำหน้าที่เป็นศูนย์กลางความร่วมมือของภาคเอกชนในการขับเคลื่อนเศรษฐกิจจังหวัดภูเก็ตสืบเนื่องมาจนถึงปัจจุบัน